分子内氢键指的是一些分子中的氢原子和带有部分正电荷的原子(如氮(N)、氧(O)等)的非共价作用力。由于氢原子带有正电荷，而电负性较高的原子带有一定的负电荷，因此它们之间存在静电相互作用。这种作用力是化学领域中非常重要的。存在分子内氢键的分子具有稳定的结构和较高的熔点、沸点等一系列性质。
分子内氢键不仅存在于常见的有机物中，如乙醇、甲醇、醋酸等，也存在于生物分子中，如蛋白质、DNA等分子中。分子内氢键的存在对于这些重要的生物分子的结构和功能发挥起到了至关重要的作用。除此之外，在药物的研制中，分子内氢键也是非常重要的一个元素。药物分子中主要含有亲水基和疏水基，而分子内氢键可以连接疏水基与亲水基之间的空间，帮助药物分子达到稳定的立体构象。
