哈尔滨工程大学研究生院是专门负责研究生培养的学院，现设有舰船与海洋工程、动力与能源工程、控制科学与工程、理学等4个研究生一级学科，以及19个研究生二级学科和7个博士后流动站。同时，研究生院拥有一批高水平学科和科研平台，包括国家一流学科、国家重点实验室、国家特色专业等。
此外，研究生院不断推进多元化的人才培养模式，积极开展研究生教育教学改革。学院拥有一支素质高、业务精、多元化的师资队伍，其中有院士、长江学者和国家杰出青年基金获得者等高层次人才。教学方面，学院逐步建立了由导师、硕士生、博士生、博士后共同参与的研究生生命周期教学体系，强化了研究生实践能力培养，全面提升了研究生的创新能力和综合素质。
作为国家重点支持的高水平大学，哈尔滨工程大学研究生院功在当前、利在千秋。未来，研究生院将继续秉持“博学、创新、贡献、担当”的校训，坚持立德树人，突出科学研究、技术创新、人才培养等重点领域，为巩固和拓展我国在船舶、海洋、能源等领域的优势，打造未来工程与科技领域的领袖做出更多的贡献。
